יאיר כהן שימש כמנכ"ל הבורסה מאז יולי 2002. קודם לכן, בין השנים 1999-2002 כיהן כיועץ המקצועי הבכיר במשרד ראש הממשלה בתקופתם של שני ראשי ממשלה – אהוד ברק ואריאל שרון. בין השנים 1995-1999 היה היועץ המקצועי הבכיר של מנכ"לי משרד האוצר דוד ברודט, שמואל סלאבין ופרופסור בן ציון זילברפרב.
בתקופת כהונתו כמנכ"ל בורסת היהלומים הנחיל יאיר כהן גישות ניהוליות מתקדמות והוביל פרויקטים חשובים בתחומי הרגולציה, האשראי הבנקאי, התשתיות והיחסים הבינלאומיים. במהלך השנים רשם גם הצלחות רבות בנושא ההשקעות הפיננסיות של הבורסה כמו גם בקידום פרויקטים ארוכי טווח בתחומי ההשקעות, התשתית והפיתוח.
נשיא בורסת היהלומים יאיר סהר הודה למנכ"ל היוצא ואמר – "לאורך כל השנים יאיר כהן תרם תרומה אדירה לקידום ופיתוח הבורסה וענף היהלומים הישראלי בכלל. הוא הותיר חותם מקצועי בלתי רגיל בכל נושא בו עסק ומשאיר אחריו בורסה חזקה ויציבה. יאיר כהן הוא מנכ"ל מקצועי מהשורה הראשונה ואנו מודים לו על השנים הנפלאות בהן תרם לענף ומאחלים לו הצלחה בהמשך הקריירה המקצועית".
